V priebehu 19. storočia existovali v meste dve budovy hlavnej stanice. Jedna z nich sa dodnes využíva.
Prvá budova hlavnej stanice vyrástla o čosi ďalej o tej súčasnej. Dodnes túto budovu na konci Šancovej ulice využíva Ministerstvo vnútra. Tá bola postavená v roku 1848.
Druhá budova stanice vznikla v roku 1871, keď sa dobudovala trať Budapešť – Štúrovo – Bratislava. Práve druhá budova sa využíva dodnes. Až na to, že v tej podobe akej vyrástla, by ste ju asi nespoznali. V roku 1989 zmenila vzhľad a to pre prístavbu vstupnej haly.
Priečelie bolo dostavané z dôvodu nepostačujúcich kapacít pre cestujúcich. Pribudla tu teda reštaurácia, úschovňa batožiny, zákaznícke centrum a samozrejme aj pokladňa na predaj lístkov. Neskôr pribudla aj čakáreň, ktorú mnohí považovali za predraženú. Chybou prístavby však je, že znehodnotila celý historický vzhľad tej pôvodnej.
Hovorilo sa však už aj o takých variantoch, že priečelie bude odstránené a obnoví sa jej pôvodný historický vzhľad. Kapacity by sa zvýšili primeranou prístavbou do strán, ktoré by však podporovali jej historickú hodnotu.